在种植前对种薯进行化学处理，既不能治疗所有的病害，也不能代替采用高质量的种薯。合理贮藏和处理只是一种廉价的保险，特别是保护种薯免遭土壤和块茎表面微生物的侵染。不足的是，它不能杀死种薯内部存在的微生物。

种薯处理可能的效益是：

①防治贮藏病害，如镰刀菌干腐。

②切开的芽块在播种前存放的一段时期内，防止芽块腐烂。

③防止芽块在土壤中腐烂（通常由镰刀菌引起）。当种植在不利的土壤条件下（冷凉和潮湿），这种病害阻碍芽块切面木栓化的形成。

④防治部分病害，如丝核菌溃疡病、疮痂病、轮枝菌萎蔫病和黑胫病。

贮藏前处理种薯，近来有些发展，通常包括应用杀菌剂（如涕必灵）。当块茎进入贮藏库时,其表面形成一层雾；在贮藏后和播种前，用转动式喷粉器喷粉处理种薯是最普遍的，这种喷粉器比振动式喷粉器覆盖更好。几种乙撑双二硫代氨基甲酸酯杀菌剂，用于浸泡种薯是有效的。可是，用药液浸薯的方法并不普遍。

当种植整薯，或芽块切开后立即播种在温暖、潮湿的苗床里时，整个薯块可以用拌种或浸种的方法进行表面消毒。这个处理只对以下病害有效，例如：丝核菌溃疡病、疮痂病和轮枝菌萎蔫病。因为，它们的病原菌普遍是土传的，主要应用芽块的地方，切后立即处理，比在切前处理更好（采用粉剂）。这个措施保护芽块切面免于土传病原物，如镰刀菌的侵染，并对种薯的部分表面消毒。

切开的种薯，不管处理还是不处理，应该立即种植。如果这个做不到，它应该贮存在打开的容器里，如存放马铃薯的篓子，以提供良好的通气。麻布袋应当只装一半，也是为了通风。切开的芽块一时播不完时,应该置于10-16℃和较高的相对湿度（85-90%）条件下3-4天，促使形成愈伤木栓层覆盖切面。如果要进一步贮存，温度应降至5℃。但是，在种植前，种薯应该再加温，以保证芽苗茁壮。应从切开的芽块中清除昆虫，特别是玉米种蛆的成虫。切开的芽块在种植前存放时间过长，可导致大量的芽块腐烂，并造成出苗不齐。